A KTM 690 Baja – hivatalos nevén sport prototípus – nagyon valószínűen a 690SM alapjait használja. Jelenleg a 690SM az egyetlen motor amely a 690-es LC4 blokkot foglalja magában. A Baja váza teljesen átdolgozott a 690SM-hez képest, új első és hátsó futóművel. Az SM Brembo féknyerge és méretes fékrácsája egy kisebb , konvencionálisabb rendszernek ad helyet, keskelnyebb felniket és off-road gumiabroncsokat láthatunk.
A motor hangolásáról nem lehet tudni pontos információkat, de valószínű, hogy az off-road jellegnek és a rövidebb áttételnek megfelelően alakítják a nyomatékgörbét. Az új endúró két gyári tesztpilóta, Cyril Despres és Chris Blais kíséretében lesz látható a május 31-én kezdődő Baja 500 futamon. A prototípust ezek után tovább tesztelik a Baja Aragonon júliusban, és a később megrendezésre kerülő Las Vegas-Renón.
